Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms