Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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