Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Atg16l1Q8C0J2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Atg16l1Q8C0J2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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