Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms