Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sf1Q64213 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms