Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim28Q62318 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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