Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sox17Q61473 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox17Q61473 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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