Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Defa20Q45VN2 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Defa20Q45VN2 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Defa20Q45VN2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Defa20Q45VN2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Defa20Q45VN2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Defa20Q45VN2 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Defa20Q45VN2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Kif1b-202ENSMUST00000055647 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Defa20Q45VN2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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