Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fchsd2Q3USJ8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms