Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arfgef3Q3UGY8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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