Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Perm1Q149B8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms