Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cntnap5cQ0V8T7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cntnap5cQ0V8T7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms