Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms