Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms