Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms