Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms