Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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