Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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