Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf5P56477 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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