Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Opn1swP51491 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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