Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms