Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms