Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GdnfP48540 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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