Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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