Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf4P43488 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms