Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KdrP35918 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KdrP35918 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KdrP35918 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KdrP35918 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms