Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprkP35822 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms