Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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