Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Saa4P31532 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms