Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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