Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18524 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18524 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18524 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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