Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Hoxb1P17919 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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