Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms