Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Myl1-201ENSMUST00000027151 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms