Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms