Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01851 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01851 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01851 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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