Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm20712-201ENSMUST00000176387 1491 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lhx8O35652 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms