Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms