Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms