Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
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