Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20830J3KML6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms