Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cfap46E9Q2C0 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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