Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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