Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms