Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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