Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Yipf7Q9JIM5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms