Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tbx18Q9EPZ6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms