Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Smg9Q9DB90 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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