Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms