Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed11Q9D2R4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms